Глава Минприроды УР Александр Нестеров заявил, что полное удаление иловых отложений из Ижевского водохранилища потребовало бы нескольких лет работы и миллиардов рублей.

Для решения проблемы засилья сине-зелёных водорослей в Ижевском водохранилище были опробованы различные мероприятия: зарыбление пруда толстолобиком, капитальный ремонт щитового хозяйства, очистка от донных отложений, вселение зелёной водоросли хлореллы.

Положительный эффект эти меры принесли, но мероприятия по экологической реабилитации водоёма необходимо продолжать. За 255 лет существования водохранилища  нём скопилось порядка 7 миллионов кубометров ила.

В 2014 году Минприроды УР приступило к практической реализации кардинального решения проблемы. Объем его финансирования 2014-2016 годы составит 478 млн. рублей. В качестве субсидий из федерального бюджета на реализацию данного проекта выделяется 373 млн. рублей.
В задачи реабилитации Ижевского водохранилища входит не только удаление донных отложений, но и создание некомфортных условий для размножения сине-зелёных водорослей. Для этого производится углубление дна и удаление водной растительности.

Однако полностью избавиться от иловых отложений вряд ли получится. В период весеннего паводка в Ижевское водохранилище поступают огромные объёмы твёрдых веществ, которые становятся донными отложениями.